进行小程序微信支付配置，是否需要通过工信部备案呢？

分两种情况，只是为商城小程序接入微信支付的话是不需要备案的，但是小程序发布是有要求的（具体点击查看），如果要为商城网站接入微信支付，商城网站则需要通过备案。